SMA Dr. Soetomo dibangun pada tanggal 30 Juli 1983 dibawah naungan Yayasan Pendidikan Cendekia Utama (YPCU) Surabaya, yang sekarang dibawah pimpinan Yayasan Bapak SETYOKARDI, BBA. Nama SMA Dr. Soetomo sendiri diambil dari nama pahlawan nasional, yaitu Dr. Soetomo, karena untuk mengenang jasanya kepada Tanah Air, SMA Dr. Soetomo mengemban misi untuk membantu pemerintah didalam bidang Pendidikan.

Yayasan Pendidikan Cendekia Utama (YPCU) sendiri sudah lebih lama dalam keikutsertaannya dalam program Pendidikan, tidak hanya SMA, tetapi juga jenjang SMP-SMA-SMK, dan Universitas.